- Τελωνείο Αθηνών (Α')
- Τελωνείο Αερολιμένα «Ελ. Βενιζέλος» (Α')
- Τελωνείο Λαυρίου (Α')
- Τελωνείο Ραφήνας (Β')
- Τελωνείο Ελευσίνας (Α')
- 1ο Τελωνείο Εισαγωγής, Ε.Φ.Κ. & Εφοδίων Πειραιά (Α')
- Αυτοτελές Τοπικό Τελωνειακό Γραφείο (Τ.Τ.Γ.) Αίγινας
- Αυτοτελές Τοπικό Τελωνειακό Γραφείο (Τ.Τ.Γ.) Κυθήρων
- Τελωνείο Πόρου (Β')
- 2ο Τελωνείο Εξαγωγών-Εισαγωγών Πειραιά (Α')
- 3ο Τελωνείο Εισαγωγής Πειραιά (Α')
- 4ο Τελωνείο Επίβλεψης Συγκροτημάτων (Τ.Ε.Σ.) Πειραιά (Α')
- Τμήμα Διαδικασιών, Ε.Φ.Κ. & Λοιπών Φορολογιών (Έδρα: ΕΛ.ΠΕ. Ασπροπύργου)
- Γραφείο Διαδικασιών, Ε.Φ.Κ. & Λοιπών Φορολογιών (Έδρα: ΕΛ.ΠΕ. Ελευσίνας)
- Τελωνείο Ηρακλείου (Α') (Ν. Ηρακλείου)
- Τελωνειακό Κλιμάκιο Καλών Λιμένων (Ν. Ηρακλείου)
- Αυτοτελές Τοπικό Τελωνειακό Γραφείο (Τ.Τ.Γ.) Τυμπακίου (Ν. Ηρακλείου)
- Τελωνείο Αγίου Νικολάου (Β') (Ν. Λασιθίου)
- Τελωνείο Σητείας (Β') (Ν. Λασιθίου)
- Τελωνείο Χανίων (Α') (Ν. Χανίων)
- Τελωνείο Ρεθύμνου (Β') (Ν. Ρεθύμνου)
- Τελωνείο Ρόδου (Α') (Ν. Δωδεκανήσου)
- Αυτοτελές Τοπικό Τελωνειακό Γραφείο (Τ.Τ.Γ.) Νισύρου (Ν. Δωδεκανήσου)
- Τελωνείο Καλύμνου (Β') (Ν. Δωδεκανήσου)
- Τελωνείο Καρπάθου (Β') (Ν. Δωδεκανήσου)
- Τελωνείο Λέρου (Β') (Ν. Δωδεκανήσου)
- Τελωνείο Κω (Β') (Ν. Δωδεκανήσου)
- Τελωνείο Πάτμου (Β') (Ν. Δωδεκανήσου)
- Τελωνείο Σύμης (Β') (Ν. Δωδεκανήσου)
- Τελωνείο Μεγίστης (Β') (Ν. Δωδεκανήσου)
- Τελωνείο Σύρου (Α') (Ν. Κυκλάδων)
- Αυτοτελές Τοπικό Τελωνειακό Γραφείο (Τ.Τ.Γ.) Τήνου (Ν. Κυκλάδων)
- Τελωνείο Θήρας (Β') (Ν. Κυκλάδων)
- Τελωνείο Μήλου (Β') (Ν. Κυκλάδων)
- Τελωνείο Μυκόνου (Β') (Ν. Κυκλάδων)
- Τελωνείο Νάξου (Β') (Ν. Κυκλάδων)
- Τελωνείο Πάρου (Β') (Ν. Κυκλάδων)